Segundo dados fornecidos pelo secretário anterior, José Francisco Bezerra, no dia 3 de outubro de 1982, foi nomeada uma comissão organizadora que assumiu em seguida, para elaboração de todo projeto para a construção da Capela de São José, nas imediações da Rua do Bosque com a Rua Guaraci. Essa comissão foi constituída pelas seguintes pessoas: Antonio Barbosa de Souza (presidente), Aparecido Bessam (vice-presidente), José Francisco Bezerra (secretário), Santo Fernandes (vice-secretário), Garcia (tesoureiro), Rubens Garcia (vice-tesoureiro) e Dora Dirce Garcia (vice-tesoureira).
Depois de muito trabalho, no dia 20 de março de 1983, foi inaugurada a Capela São José, cuja primeira missa foi presidida pelo padre Ismael. Contudo, sua oficialização veio a ocorrer somente em 15 de novembro de 1987.
Em setembro de 1983 foi organizada pela comissão e por mais colaboradores, assim como grupo de pastorais, a primeira Quermesse da Capela São José, que teve sequência até o fim de outubro do mesmo ano. Em dezembro de 1983, a pedido de dom João Berjese, se reuniu a base da comunidade para a preparação da Novena de Natal, coordenada pelo seminarista Rafael. Esse grupo de base enviou uma carta a dom João sugerindo uma nova sociedade para acompanhar a realidade do nosso bairro.
No dia 24 de janeiro de 1984, reuniu-se novamente a comissão com a presença do padre Ismael, para a preparação da Campanha da Fraternidade e a Festa de São José, que culminou com a celebração da Primeira Comunhão da primeira turma de Catequese da paróquia, com a presença de dom João.
O padre Ismael, a pedido de Dom João, pediu que a comissão escolhesse um representante leigo da comunidade para representá-la junto ao Conselho Diocesano de Pastoral. Foi apontado o nome de Henrique de Oliveira Filho, que aceitou a indicação. Esta foi a última decisão tomada pela comissão, que passou a se chamar de Conselho Pastoral da Paróquia São José.
Em 17 de outubro de 1984 surgiu as pastorais Operária e do Dízimo. Padre Ismael trabalhava com afinco para arrecadar recursos para a construção da igreja. Em 1985, com a conclusão das obras, o padre Ismael foi transferido e o bispo de Guarulhos, dom João Bergese, assumiu o comando da paróquia.
Com o crescimento do número de fiéis, dom João decidiu aumentar de uma para duas missas dominicais na paróquia, às 8h e às 10h, a partir de 29 de março de 1987. A segunda seria focada nas crianças e nos jovens. No mesmo ano, em 4 de outubro, houve a inauguração da nova igreja.
Em 1988, a paróquia contrata uma secretária para organizar os trabalhos e dar melhor andamento à secretaria paroquial. Na Assembleia paroquial de 31 de janeiro de 1988, os agentes decidiram criar um Curso de Noivos, formar uma Equipe de Liturgia e incentivar os grupos de base, focar na situação dos menores, além de criar uma equipe de limpeza.
Foram párocos os padres Peppe (1987), Hermano (1987 a 1991), Mauro (1991 a 2009), Francisco (2009 e 2010), Paulo Leandro (2010 a 2018) e padre Weber Galvani, que é responsável pela paróquia desde 30 de outubro de 2018.
Além da capela São José, formavam a paróquia as comunidades São Barnabé, no Jardim Gracinda, São Paulo Apóstolo, no Parque Continental II, Santa Rosa de Lima, no Parque Continental III, e São Pedro Apóstolo, na Vila Operária.
Em 2021, houve o desmembramento da Paróquia São José, que culminou com o surgimento da Paróquia São Paulo Apóstolo. Desde então, a Paróquia São José passou a contar apenas com a igreja matriz e a Capela Santa Rosa de Lima.
